Породу длинношерстных японских бобтейлов (Japanese Bobtail Longhair) официально признали не так давно. Хотя представителей короткохвостых японских кошек с длинной шерстью часто встречали, в частности на севере страны Восходящего солнца (Японии).

В пометах короткошерстных японских бобтейлов время от времени появлялись длинношерстные котята. Вначале это считалось случайными отклонениями от нормы. Тем не менее, длинношерстные варианты японских бобтейлов встречались издавна, о чем красноречиво свидетельствуют гравюры древних японских мастеров живописи.

Заводчики принялись за работу и добивались официального признания этой вариации породы японского бобтейла. В 1993 году CFA длинношерстных бобтейлов приняли для принятия участия на официальном чемпионате.

Большинство заводчиков занимаются разведением и выставление японских бобтейлов обоих вариантов, однако некоторые придерживаются строгой специализации на одном из представленных типов или короткошерстном, или длинношерстном.